Primeiro, acesse o painel, através do endereço:
http://<seudominio>:8880
Por exemplo, no caso do domínio hospedagemsegura.com.br, o painel deve ser acessado pelo link ahospedagemsegura.com.br:8880:

O nome de usuário é o domínio do cliente, por exemplo, hospedagemsegura.com.br e a senha, a mesma utilizada para acesso via FTP.
Após efetuar login, a página inicial do painel será exibida. Alguns ícones que representam opções de administração do painel estarão disponíveis de forma semelhante à seguinte:

Alterando as permissões
Selecione a opção Gerenciador de Arquivos para verificar e alterar as permissões de diretórios e arquivos do seu domínio. Será exibida uma lista com os diretórios do seu domínio:

Acesse o diretório httpdocs. Para testar, alteraremos as permissões do diretório tutorial. Veja a lista de subdiretórios e arquivos dentro de httpdocs:

O cadeado marcado de vermelho é o cadeado para edição das permissões do diretório. Clicamos então sobre o cadeado correspondente ao diretório tutorial e vemos a tela de edição das permissões:

Então selecionamos um dos usuários (ISUR_hsegura, por exemplo) e configuramos as permissões para permitir leitura e escrita:

Após definir estas permissões, clicamos em OK e está feito.